除此之外朱见深还承认了叔叔朱祁钰是景泰帝，恢复他的名号，重修景泰帝陵寝。这些以德报怨的行为都让群臣对他赞赏不已，纷纷表示必将忠诚于他。
解决了内忧之后，朱见深便想着要排除外患。广西瑶族叛乱，朱见深任命都督同知赵辅为征夷将军，总领所有总兵，最终平定了广西大藤峡的瑶族叛乱。第二年毛里孩发生叛乱，进攻固原，朱见深授朱永为平胡将军前去平定叛乱，不管怎么样，反反复复最终获胜。不过让人震撼的一场战争就是汪直对战女真部落。女真部落早年间就对明朝土地多有侵犯，到了成化年间更是狂妄至极，屡次进犯。
于是朱见深下令要剿灭女真部落，同时还邀请了邻国参战，最终女真首领李满住和他的儿子全部被杀，其余被杀的女真族有630余人，俘虏240余人，几乎是灭族了。这就是满清入关之后负责编纂《明史》，由于记恨朱见深的所作所为，所以在记录朱见深时刻意地进行抹黑。不管怎么样但滥施赏赐，专宠汪直，寄情于声色货利，奇巧淫技，导致厂卫特务横行，农民起义不断。也是朱见深在位时的注释。
而这一次朱见深又出乎所有人的意料，诏命何乔新前往播州，乃宣杨友、杨爱二人面对真伪，尽得其始未，遂为杨爱正名，夺杨友之官，斩杨友同谋张渊。播州遂平。可以说这一次朱见深又赌对了，要是换了他人还真不好说，四川将又一次引起兵变，可见何乔新的能力。