马尼拉通过几年的建设，已经成为东南亚最大的商品集散地，马尼拉港经过这几年的一再扩建，已经达到了相当大的规模。起码在这个时代，全世界任何一座港口都无法与之相提并论。
光是那一座座钢筋水泥码头和栈桥，还有码头边那连成一片的仓储区，就能让初次来到这里的西方乡巴佬叹为观止。更别说马尼拉港的现代化管理流程了，从商船进港、引航、装卸、运输、仓储、理货、托运、报关、报检等工作都有专业人员，为各国商人提供一条龙服务。
另外商船进出港、靠离岸、货物装卸及仓储、引水、托船、给水、带解缆、船只维护、食品日用品物资补给等工作都有专人为你安排，各项设施也都非常齐备，管理的井井有条，从来不出半点差错。只要商船到了马尼拉港，各国商人就再不用操心其他事情，只管专门上岸进行交易。
但这些工作都是要收费的，而且价格奇贵，童叟无欺。可你别嫌贵，这么贵还不打折！
各国商船只要来了一次，咬着牙交了一笔费用离港后，都是大骂远东公司黑心，但没隔多久又屁颠屁颠的回来了。商人只讲利润，如今马尼拉在他们的眼里，那就是金山银山，他们可以任意在这里选择他们认为能够赚钱的商品，拉回国内去销售，赚取大笔的利润。
马尼拉湾深处还建有一座军港，这里属于军事区，所有船只靠近，不听劝阻会被就地击沉。军港码头不光是停泊吕宋海岸守备队的战舰。远东公司进出港的物资。都是在这里装卸。这里建了一座深水码头，专供两艘万吨巨轮停泊。
每年公司都会派两艘万吨巨轮抵达马尼拉，最多的一年曾经往返三次。将囤积在这里的物资拉回海参崴和辽东。其中包括来自暹罗和东南亚其他国家的稻米、烟草、杂粮等农副产品，还有吕宋开采的铁、铜、金、钼、铝土等矿产。
除了两艘万吨巨轮，海军部的每年都会派出大量的风帆船往返于马尼拉和辽东、海参崴。运送粮食和劳工，每年公司从马尼拉拉回来的稻米将近四万余吨，运送土著劳工三万名以上。
马尼拉的繁荣，让大批的西方各国商人，纷纷跨越大洋，来到了这里。他们已经不局限于果阿-马尼拉-里斯本航线。马尼拉—阿卡普尔科航线，现在欧洲和新大陆的很多商船都组成了船队，穿过马六甲来到马尼拉进行交易。
当年西班牙王国在南美内陆深处的里科峰发现了最丰富的银矿母脉。西班牙人立即动用了无数印第安人苦力开采银矿。1550-1850年间，数百万印第安人和非洲奴隶葬身矿山。一时间市面上流通的白银多得前所未见，所有东西都可以根据其相应于白银的价格来买卖。白银本身并无太多价值可言。然而它出现的时机和数量正好符合了经济扩张的需求。
坐拥银山的西班牙人，除了将白银直接运回本土，很快又将触角伸到了传说中的神秘东方。著名的马尼拉大帆船很快扬帆，从墨西哥港口阿卡普尔科出发，将里科峰的白银运到西班牙的吕宋的殖民地马尼拉。
西班牙铸造的8雷阿尔银币（约合27.468克）专门用于对外贸易，其银纯度稳定地维持在0.931，因此很受中国商人信任，输入中国后可以直接熔掉做成银锭。那里的物价如此便宜。中国的生产力又如此惊人，能够源源不断地生产出令欧洲人艳羡渴慕的奢侈品和日用品，于是马尼拉大帆船的航线很快固定下来。成为在马尼拉和墨西哥之间每年往返的商贸要渠。
历史上西班牙王国的墨西哥行省的总督，可以决定帆船装载多少货物，尽管其所有权归王室。因为管理是肥缺，总督有权安排职务，于是要职时常被不懂行的关系户占据。每一个住在新西班牙总督区的西班牙人都按阶层拥有大帆船上的货位，每个货位有一张票。寡妇可以享受丈夫的配额，子女可以继承。买卖货位后来也成了十分有利可图的生意。
因为帆船贸易利润太高。夹带私货的情形十分严重。每次大帆船申报载货从马尼拉离港后，便有许多小船跟随驶出。在途中加载私货以逃税。申报价值200万比索货物的大帆船，实际装载的可能达3-4倍甚至更多。因为到了墨西哥并没有人再次查验货物，官方采取睁只眼闭只眼的“缄默原则”，只管向申报货物收税。
远东攻占了吕宋，并两次打败了西班牙人，原本应该断绝的大帆船贸易，却照比以往成倍的增长了起来。新大陆的西班牙权贵们为了自己的利益，哪里还管什么王国的存在，义无反顾的投入到马尼拉-阿卡普尔科的大帆船贸易中来。更多的大帆船将整船的白银运到马尼拉，在这里装满各种货物再运回新大陆和欧洲。
自从澳门成了无人敢去的“神弃之地”。葡萄牙殖民者也失去了他们在大明的落脚点，等他们反应过来，发现了其中的猫腻后，已经无力回天。
吕宋沿海、大明东南沿海、日本沿海遍布着几千艘华人海盗船，只要葡萄牙的商船出现，这些华人海盗船就像闻到血腥味的鲨鱼群似的，疯狂的扑上来大肆撕咬。
葡萄牙人不但失去了澳门，现在连日本长崎航线也断了。原来他们还可以仗着巨大的风帆船和华人海盗的戎克船周旋，可如今远东各个海岸警备队的飞剪船和斯鲁普船单桅纵帆船，那都不是一般的凶残，葡萄牙的商船遇到他们算是倒了血霉。只要敢于反抗的，那就是被击沉的结局。
最让他们郁闷的是，葡萄牙的商船只要出现在吕宋岛以北，哪怕是他们偷偷摸摸的进来，可也总是被远东逮个正着。不光是他们，很多荷兰、英国和西班牙的商船船主，还有大明的海商，都想企图绕过马尼拉，私自出去交易。